أدت الهولوكوست في ليتوانيا إلى تدمير شبه كامل لليهود الليتوانيين (ليتفاكس) واليهود البولنديين ، الذين يعيشون في Generalbezirk Litauen من Reichskommissariat Ostland داخل ليتوانيا التي يسيطر عليها النازيون الاشتراكية السوفياتية. من بين ما يقرب من 208،000 - 210،000 يهودي ، قُتل ما يقدر بـ 190،000–195،000 قبل نهاية الحرب العالمية الثانية ، معظمهم بين يونيو وديسمبر 1941. تم ذبح أكثر من 95٪ من السكان اليهود في ليتوانيا على مدى ثلاث سنوات من الاحتلال الألماني - وأكثر من ذلك الدمار الكامل أكثر من أي دولة أخرى تضررت من الهولوكوست. يعزو المؤرخون هذا إلى التعاون الهائل في الإبادة الجماعية من قبل الجماعات شبه العسكرية المحلية غير اليهودية ، على الرغم من أن أسباب هذا التعاون لا تزال موضع نقاش. أسفرت المحرقة عن أكبر خسارة في الأرواح على الإطلاق في فترة زمنية قصيرة جدًا في تاريخ ليتوانيا ، حيث وقعت الأحداث في المناطق الغربية من الاتحاد السوفيتي التي احتلتها ألمانيا النازية في الأسابيع الأولى بعد الغزو الألماني ، بما في ذلك شهدت ليتوانيا اشتدادًا حادًا للهولوكوست ، وكان أحد المكونات المهمة للهولوكوست في ليتوانيا هو أن الإدارة الألمانية النازية قامت بتأجيج معاداة السامية من خلال إلقاء اللوم على المجتمع اليهودي في ضم النظام السوفيتي الأخير لليتوانيا قبل عام. كان العامل المهم الآخر هو المدى الكبير الذي اعتمد فيه تصميم النازيين على التنظيم المادي ، وإعداد وتنفيذ أوامرهم من قبل المتعاونين الليتوانيين المحليين في نظام الاحتلال النازي. من قبل الليتوانيين في الإبادة الجماعية ، بما في ذلك العديد من القوميين الليتوانيين البارزين ، لا يزال مثيرًا للجدل.