Louis Pasteur y Claude Bernard completan el experimento falseando la teoría de la generación espontánea.

La generación espontánea es un cuerpo de pensamiento sobre la formación ordinaria de organismos vivos sin descendencia de organismos similares. La teoría de la generación espontánea sostenía que las criaturas vivas podían surgir de la materia no viva y que tales procesos eran comunes y regulares. Se planteó la hipótesis de que ciertas formas, como las pulgas, podrían surgir de materia inanimada como el polvo, o que los gusanos podrían surgir de la carne muerta.

La doctrina de la generación espontánea fue sintetizada coherentemente por Aristóteles, quien compiló y amplió el trabajo de los filósofos naturales anteriores y las diversas explicaciones antiguas sobre la aparición de los organismos. La generación espontánea fue tomada como un hecho científico durante dos milenios. Aunque desafiado en los siglos XVII y XVIII por los experimentos de Francesco Redi y Lazzaro Spallanzani, no fue desacreditado hasta el trabajo del químico francés Louis Pasteur y el físico irlandés John Tyndall a mediados del siglo XIX.

El rechazo de la generación espontánea ya no es controvertido entre los biólogos. A mediados del siglo XIX, se consideró que los experimentos de Louis Pasteur y otros habían refutado la teoría tradicional de la generación espontánea y respaldado la biogénesis.

Louis Pasteur (en francés: [lwi pastœʁ]; 27 de diciembre de 1822 - 28 de septiembre de 1895) fue un químico y microbiólogo francés conocido por sus descubrimientos sobre los principios de la vacunación, la fermentación microbiana y la pasteurización. Su investigación en química condujo a avances notables en la comprensión de las causas y la prevención de enfermedades, lo que sentó las bases de la higiene, la salud pública y gran parte de la medicina moderna. Sus obras se atribuyen a salvar millones de vidas a través del desarrollo de vacunas contra la rabia y el ántrax. Se le considera uno de los fundadores de la bacteriología moderna y ha sido honrado como el "padre de la bacteriología" y como el "padre de la microbiología" (junto con Robert Koch, y este último epíteto también atribuido a Antonie van Leeuwenhoek).

Pasteur fue el responsable de refutar la doctrina de la generación espontánea. Bajo los auspicios de la Academia Francesa de Ciencias, su experimento demostró que en frascos esterilizados y sellados nunca se desarrollaba nada; y, por el contrario, en frascos esterilizados pero abiertos, podrían crecer microorganismos. Por este experimento, la academia le otorgó el Premio Alhumbert dotado con 2.500 francos en 1862.

Pasteur también es considerado como uno de los padres de la teoría de los gérmenes de las enfermedades, que era un concepto médico menor en ese momento. Sus muchos experimentos demostraron que las enfermedades podían prevenirse matando o deteniendo los gérmenes, apoyando así directamente la teoría de los gérmenes y su aplicación en la medicina clínica. El público en general lo conoce mejor por su invención de la técnica de tratar la leche y el vino para detener la contaminación bacteriana, un proceso que ahora se llama pasteurización. Pasteur también hizo importantes descubrimientos en química, sobre todo en la base molecular de la asimetría de ciertos cristales y la racemización. Al principio de su carrera, su investigación del ácido tartárico resultó en la primera resolución de lo que ahora se llama isómeros ópticos. Su trabajo abrió el camino a la comprensión actual de un principio fundamental en la estructura de los compuestos orgánicos.

Fue director del Instituto Pasteur, establecido en 1887, hasta su muerte, y su cuerpo fue enterrado en una bóveda debajo del instituto. Aunque Pasteur hizo experimentos innovadores, su reputación se asoció con varias controversias. La reevaluación histórica de su cuaderno reveló que practicaba el engaño para vencer a sus rivales.