Un grupo de los primeros cristianos japoneses son asesinados por el nuevo gobierno de Japón por ser vistos como una amenaza para la sociedad japonesa.

Los Veintiséis Mártires de Japón (en japonés: , Hepburn: Nihon Nijroku Seijin) fueron un grupo de católicos que fueron ejecutados por crucifixión el 5 de febrero de 1597 en Nagasaki, Japón. Su martirio es especialmente significativo en la historia de la Iglesia Católica en Japón.

Un comienzo prometedor para las misiones católicas en Japón con quizás hasta 300.000 católicos a fines del siglo XVI se encontró con complicaciones por la competencia entre los grupos misioneros, las dificultades políticas entre Portugal y España y las facciones dentro del gobierno de Japón. El cristianismo fue suprimido y fue durante este tiempo que los 26 mártires fueron ejecutados. Para 1630, el catolicismo había pasado a la clandestinidad. Cuando los misioneros cristianos regresaron a Japón 250 años después, encontraron una comunidad de "católicos ocultos" que habían sobrevivido bajo tierra.

Kakure Kirishitan (en japonés: 隠れキリシタン, lit. '"cristiano oculto") es un término moderno para un miembro de la Iglesia Católica en Japón que pasó a la clandestinidad a principios del período Edo a principios del siglo XVII debido a la represión del cristianismo por el shogunato Tokugawa.