La Basílica Menor de San Sebastián (en filipino: Basilika Menor ng San Sebastian; en español: Basílica Menor de San Sebastián), más conocida como Iglesia de San Sebastián (en filipino: Simbahan ng San Sebastian) o Basílica de San Sebastián, es una basílica menor de la Iglesia Católica Romana Iglesia en Manila, Filipinas. Es la iglesia de la Parroquia de San Sebastián, y también un Santuario de Nuestra Señora del Monte Carmelo, o Nuestra Señora del Monte Carmelo.

Completada en 1891, la Iglesia de San Sebastián se destaca por su arquitectura. Un ejemplo de la arquitectura del Renacimiento gótico en Filipinas, es la única iglesia construida con acero en Filipinas. Fue designada Monumento Histórico Nacional en 1973 y Tesoro Cultural Nacional en 2011. La Iglesia de San Sebastián está bajo el cuidado de la Orden de Agustinos Recoletos, quienes también operan el Colegio San Sebastián-Recoletos adyacente a la basílica. Está ubicado en la Plaza del Carmen, en el extremo este de la Avenida Recto, en Quiapo, Manila.