El Incidente Isshi (乙巳の変, Isshi no Hen) toma su nombre del nombre zodiológico del año 645 durante el cual ocurrió la Reforma Taika, un evento transformador en la historia imperial japonesa.

El incidente fue un complot exitoso de Nakatomi no Kamatari, el príncipe Naka no Ōe y otros que conspiraron para eliminar la rama principal del clan Soga, comenzando con el asesinato de Soga no Iruka. El asesinato de Iruka tuvo lugar el 10 de julio de 645 ( fecha tradicional japonesa: día 12 del sexto mes de 645), durante una ceremonia de la corte en la que Ishikawa no Maro leía a la emperatriz Kōgyoku memoriales de los Tres Reinos de Corea. El príncipe Naka no Ōe había hecho elaborados preparativos, incluido el cierre de las puertas del palacio, sobornar a varios guardias del palacio, esconder una lanza en el salón donde se llevaría a cabo la ceremonia y ordenar a cuatro hombres armados que atacaran a Iruka. Sin embargo, cuando quedó claro que los cuatro hombres estaban demasiado asustados para cumplir las órdenes, Naka no Ōe se abalanzó sobre Iruka y le cortó la cabeza y el hombro. Iruka no fue asesinado de inmediato, pero protestó por su inocencia y abogó por una investigación. El príncipe Naka no Ōe defendió su caso ante la emperatriz Kōgyoku, y cuando ella se retiró para considerar el asunto, los cuatro guardias finalmente corrieron a Iruka nuevamente y completaron el asesinato. Poco después, el padre de Iruka, Soga no Emishi, se suicidó prendiendo fuego a su residencia. La conflagración destruyó la copia manuscrita del Tennōki y muchos otros tesoros imperiales que los Soga habían tomado para su custodia, pero Fune no Fubitoesaka rápidamente agarró el Kokki en llamas. Más tarde, se dice que se lo presentó a Naka no Ōe; pero no quedan copias conocidas de la obra. La violencia realmente se desarrolló en presencia de Kōgyoku. La Emperatriz respondió a este shock decidiendo renunciar al trono. La sociedad japonesa durante el período Asuka era sensible a los problemas de "contaminación", tanto espiritual como personal. Las muertes, especialmente un asesinato violento en las proximidades físicas de la Emperatriz, se consideraban entre los peores actos de contaminación posibles, un evento tan sorprendente que habría justificado días de reclusión en un proceso incierto que intentaba reparar lo que habría sido. interpretarse como una especie de blasfemia.

Aunque Kōgyoku quería abdicar inmediatamente a favor de Naka no Ōe, siguiendo el consejo de Nakatomi no Kamatari, insistió en que el trono debería pasar a su hermano mayor, Furuhito no Ōe, o a su tío materno (hermano de Kōgyoku), el príncipe Karu. Furuhito no Ōe resolvió el callejón sin salida al declarar su intención de renunciar a cualquier pretensión al trono tomando la tonsura de un monje budista. Ese mismo día, que tradicionalmente se dice que es el 12 de julio de 645, Furuhito no Ōe se afeitó el cabello en Hōkō-ji, al aire libre entre el Salón del Buda y la pagoda. En este punto, Kōgyoku abdicó a favor de su hermano, quien poco después accedió al trono como emperador Kōtoku (645–654). Después de la muerte de Kōtoku, Kōgyoku tomó el trono una vez más como Saimei (r. 655–661), antes de que el propio Naka no Ōe finalmente tomara el trono como emperador Tenji (661–672).