Fort Coligny fue una fortaleza fundada por Nicolás Durand de Villegaignon en Río de Janeiro, Brasil en 1555, en lo que constituyó el llamado episodio histórico de la Antártida de Francia.
Para protegerse de los ataques de los indios hostiles y de los portugueses, Villegaignon construyó la fortaleza con la ayuda de los 500 colonos que viajaban con él en dos barcos armados por el rey de Francia, en una pequeña isla llamada Serigipe por los indios de la región, cerca de la desembocadura de la gran Bahía de Guanabara. La isla era rocosa y casi yerma, pero cumplía el propósito de Villegaignon de estar cerca de la costa, logrando al mismo tiempo una buena posición defensiva contra los ataques por mar y tierra.
La fortaleza cayó y fue destruida el 17 de marzo de 1560, bajo el asedio de la marina y las tropas portuguesas al mando de Mem de Sá, tercer gobernador general de Brasil. Villegaignon ya había regresado a Francia, en 1558.
La fortaleza fue nombrada así en honor al partidario y amigo de Villegaignon, el almirante francés y líder de los hugonotes, Gaspard de Coligny. Después de la fundación de Río de Janeiro en 1565 por Estácio de Sá y la expulsión de los franceses en 1567, los portugueses construyeron allí una nueva fortaleza para defender la desembocadura de la Bahía de Guanabara, cruzando fuego con otras dos fortalezas, Guajará y Santa Cruz. Esta fortaleza fue destruida casi en su totalidad por los bombardeos de una revuelta de la Marina, en 1893. Hoy, la isla, que pasó a llamarse Isla de Villegaignon, es sede de la Escuela Naval desde 1938, y ahora está permanentemente conectada con el continente, cerca de la Aeropuerto Santos Dumont.