El 13 de mayo de 2005 estallaron protestas en Andijan, Uzbekistán. En un momento, las tropas del Servicio de Seguridad Nacional de Uzbekistán (SNB) dispararon contra una multitud de manifestantes. Las estimaciones de los muertos el 13 de mayo oscilan entre 187, el recuento oficial del gobierno, y varios cientos. Un desertor del SNB alegó que 1.500 fueron asesinados. Los cuerpos de muchos de los que murieron supuestamente fueron escondidos en fosas comunes después de la masacre. Existen tres relatos sobre los hechos:

El gobierno uzbeko dijo que el Movimiento Islámico de Uzbekistán organizó los disturbios y que los manifestantes eran miembros de Hizb ut-Tahrir.

Los críticos del gobierno argumentan que la etiqueta de radical islamista proporciona un pretexto para mantener un régimen represivo en el país.

Una tercera teoría es que la disputa fue realmente una lucha entre clanes por el poder estatal. Sin embargo, el gobierno uzbeko reconoció que las malas condiciones económicas en la región y el resentimiento popular jugaron un papel en el levantamiento. Es posible que las tropas hayan disparado indiscriminadamente para evitar una revolución de colores o hayan actuado legítimamente para sofocar una fuga de prisión. Se sabe que el gobierno tiene vínculos estrechos con el gobierno de los EE. UU., y la administración Bush había declarado que Uzbekistán era vital para la seguridad de los EE. UU. porque alquiló una gran base militar a las fuerzas militares de los EE. UU. El gobierno uzbeko ordenó el cierre de la base aérea estadounidense Karshi-Khanabad y mejoró los lazos con la República Popular China y la Federación Rusa, quienes apoyaron la respuesta del gobierno en Andijan.