Dans la guerre de Treize Ans, le Conseil secret de la Confédération prussienne envoie un acte formel de désobéissance au Grand Maître.

La Confédération prussienne ( allemand : Preuischer Bund , polonais : Zwizek Pruski ) était une organisation formée le 21 février 1440 à Kwidzyn (alors officiellement Marienwerder ) par un groupe de 53 nobles et clercs et 19 villes de Prusse, pour s'opposer à l'arbitraire de la teutonique Chevaliers. Il était basé sur une organisation similaire antérieure, l'Union des Lézards créée en 1397 par les nobles de Chemno Land.

En 1454, le chef de la Confédération, Johannes von Baysen (Jan Bayski), demanda formellement au roi Casimir IV Jagellon d'incorporer la Prusse au Royaume de Pologne. Cela a marqué le début de la guerre de treize ans entre l'État de l'Ordre et la Pologne, les villes cofinançant les dépenses militaires de cette dernière.

La guerre de treize ans ( allemand : Dreizehnjähriger Krieg ; polonais : wojna trzynastoletnia ), également appelée guerre des villes , était un conflit mené en 1454-1466 entre la Confédération prussienne , alliée à la couronne du royaume de Pologne , et le État de l'Ordre Teutonique.

La guerre a commencé comme un soulèvement des villes prussiennes et de la noblesse locale pour gagner l'indépendance des chevaliers teutoniques. En 1454, Casimir IV épousa Elisabeth de Habsbourg et la Confédération prussienne demanda de l'aide au roi de Pologne Casimir IV Jagellon et proposa d'accepter le roi comme protecteur à la place de l'Ordre teutonique. Lorsque le roi a donné son assentiment, la guerre a éclaté entre les partisans de la Confédération prussienne, soutenus par la Pologne, et les partisans du gouvernement des chevaliers teutoniques.

La guerre de Treize Ans s'est terminée par la victoire de la Confédération prussienne et de la Pologne et par la deuxième paix de Thorn (1466). Cela fut bientôt suivi par la guerre des prêtres (1467-1479), une longue dispute sur l'indépendance du prince-évêché prussien de Warmie (Ermland), dans laquelle les chevaliers demandèrent également la révision de la paix de Thorn.