L'incident d'Isshi (乙巳の変, Isshi no Hen) tire son nom du nom zodiologique de l'année 645 au cours de laquelle s'est produite la réforme Taika, un événement transformateur dans l'histoire impériale japonaise.
L'incident était un complot réussi par Nakatomi no Kamatari, le prince Naka no Ōe et d'autres qui ont conspiré pour éliminer la branche principale du clan Soga, en commençant par l'assassinat de Soga no Iruka. L'assassinat d'Iruka a eu lieu le 10 juillet 645 ( date japonaise traditionnelle : 12e jour du 6e mois de 645), lors d'une cérémonie judiciaire au cours de laquelle des mémoriaux des Trois Royaumes de Corée étaient lus à l'impératrice Kōgyoku par Ishikawa no Maro. Le prince Naka no Ōe avait fait des préparatifs élaborés, notamment en fermant les portes du palais, en soudoyant plusieurs gardes du palais, en cachant une lance dans la salle où la cérémonie devait avoir lieu et en ordonnant à quatre hommes armés d'attaquer Iruka. Cependant, lorsqu'il devint clair que les quatre hommes étaient trop effrayés pour exécuter les ordres, Naka no Ōe se précipita lui-même sur Iruka et lui ouvrit la tête et l'épaule. Iruka n'a pas été tué immédiatement, mais a protesté de son innocence et a plaidé pour une enquête. Le prince Naka no Ōe a plaidé sa cause devant l'impératrice Kōgyoku, et lorsqu'elle s'est retirée pour examiner la question, les quatre gardes ont finalement précipité Iruka à nouveau et ont achevé le meurtre. Peu de temps après, le père d'Iruka, Soga no Emishi, s'est suicidé en mettant le feu à sa résidence. L'incendie a détruit la copie manuscrite du Tennōki et de nombreux autres trésors impériaux qui avaient été mis en lieu sûr par les Soga, mais Fune no Fubitoesaka a rapidement saisi le Kokki brûlant des flammes. Plus tard, il l'aurait présenté à Naka no Ōe ; mais il ne reste aucune copie existante connue de l'œuvre. La violence s'est réellement déroulée en présence de Kōgyoku. L'impératrice répondit à ce choc en se décidant à renoncer au trône. La société japonaise de la période Asuka était sensible aux problèmes de « pollution », à la fois spirituelle et personnelle. Les décès - en particulier un meurtre violent à proximité physique de l'Impératrice - étaient considérés comme l'un des pires actes de pollution possibles - un événement si stupéfiant qu'il aurait justifié des jours d'isolement dans un processus incertain tentant de réparer ce qui aurait été interprété comme une sorte de grossièreté.
Bien que Kōgyoku veuille abdiquer immédiatement en faveur de Naka no Ōe, sur les conseils de Nakatomi no Kamatari, il insiste pour que le trône passe à la place à son frère aîné, Furuhito no Ōe, ou à son oncle maternel (le frère de Kōgyoku) le prince Karu. Furuhito no Ōe a résolu l'impasse en déclarant son intention de renoncer à toute prétention au trône en prenant la tonsure d'un moine bouddhiste. Ce même jour, traditionnellement dit être le 12 juillet 645, Furuhito no Ōe se rasa les cheveux au Hōkō-ji, en plein air entre la salle du Bouddha et la pagode. À ce stade, Kōgyoku a abdiqué en faveur de son frère, qui a accédé peu de temps après au trône en tant qu'empereur Kōtoku (645-654). Après la mort de Kōtoku, Kōgyoku a repris le trône en tant que Saimei (r. 655–661), avant que Naka no Ōe lui-même ne prenne finalement le trône en tant qu'empereur Tenji (661–672).