L'Université nationale de San Marcos (en espagnol : Universidad Nacional Mayor de San Marcos, UNMSM) est une université publique de recherche à Lima, la capitale du Pérou. Aussi connue sous le nom d'Université du Pérou et de "Doyen de l'Université des Amériques", c'est la première officiellement établie (privilège de Charles Quint, empereur romain germanique) et la plus ancienne université en fonctionnement continu des Amériques. Depuis sa fondation, elle était communément appelée «l'Université royale et pontificale de la ville des rois de Lima» jusqu'à la période de la vice-royauté et à partir de maintenant, elle est appelée Universidad Nacional Mayor de San Marcos ou La Decana de América.
C'est l'une des rares universités péruviennes à avoir réussi à se classer au premier rang national dans plusieurs éditions de différents classements universitaires internationaux. Son campus principal, la Cité Universitaire, est situé à Lima. Elle a été affrété le 12 mai 1551 par un décret royal signé par Charles Ier d'Espagne, ce qui en fait la plus ancienne université officiellement établie des Amériques.
San Marcos compte 66 écoles académiques-professionnelles, organisées en 20 facultés et 6 domaines académiques. Toutes les facultés offrent des diplômes de premier cycle et des cycles supérieurs. Le corps étudiant se compose de plus de 30 000 étudiants de premier cycle et de 4 000 étudiants des cycles supérieurs de tout le pays, ainsi que de certains étudiants internationaux. L'université compte un certain nombre d'institutions publiques sous son gouvernement, telles que le centre culturel San Marcos et le musée d'histoire naturelle de Lima.
Parmi les anciens élèves notables figurent le lauréat péruvien du prix Nobel Mario Vargas Llosa et vingt et un présidents péruviens. San Marcos est également reconnu pour la qualité de son contenu curriculaire, un processus d'admission compétitif, ainsi que pour être un centre de recherche scientifique. Plusieurs penseurs, chercheurs, scientifiques, politiciens et écrivains influents péruviens et latino-américains y ont étudié, ce qui souligne le rôle de premier plan de San Marcos en tant qu'établissement d'enseignement dans l'histoire du Pérou et du monde.