La peste de San Francisco de 1900 à 1904 était une épidémie de peste bubonique centrée sur le quartier chinois de San Francisco. Ce fut la première épidémie de peste aux États-Unis continentaux. L'épidémie a été reconnue par les autorités médicales en mars 1900, mais son existence a été niée pendant plus de deux ans par le gouverneur de Californie, Henry Gage. Son refus était fondé sur des raisons commerciales, pour protéger la réputation de San Francisco et de la Californie et pour éviter la perte de revenus due à la quarantaine. L'incapacité à agir rapidement a peut-être permis à la maladie de s'établir parmi les populations animales locales. Les autorités fédérales ont travaillé pour prouver qu'il y avait un problème de santé majeur, et elles ont isolé la zone touchée ; cela a sapé la crédibilité de Gage et il a perdu le poste de gouverneur aux élections de 1902. Le nouveau gouverneur, George Pardee, a mis en œuvre des mesures de santé publique et l'épidémie a été stoppée en 1904. Il y a eu 121 cas identifiés, entraînant 119 décès. Une grande partie de la ville de San Francisco a été détruite par un incendie lors du tremblement de terre de 1906 à San Francisco, y compris tous du quartier chinois. Le processus de reconstruction a commencé immédiatement mais a pris plusieurs années. Alors que la reconstruction battait son plein, une deuxième épidémie de peste frappa San Francisco en mai et août 1907, mais elle n'était pas centrée sur Chinatown. Des cas se sont produits au hasard dans toute la ville, y compris des cas identifiés dans la baie d'Oakland. Les politiciens et la presse de San Francisco ont réagi très différemment cette fois, souhaitant que le problème soit résolu rapidement. Les autorités sanitaires ont travaillé rapidement pour évaluer et éradiquer la maladie. Environ 2 millions de dollars ont été dépensés entre 1907 et 1911 pour tuer le plus de rats possible dans la ville afin de contrôler l'un des vecteurs de la maladie. En juin 1908, 160 autres cas avaient été identifiés, dont 78 décès, un taux de mortalité bien inférieur à celui 1900–1904. Toutes les personnes infectées étaient européennes et le spermophile de Californie a été identifié comme un autre vecteur de la maladie. Le refus initial de l'infection de 1900 a peut-être permis à l'agent pathogène de s'implanter pour la première fois en Amérique, d'où il s'est propagé sporadiquement à d'autres États sous la forme de peste sylvatique (peste rurale). Cependant, il est possible que l'infection par le spermophile soit antérieure à 1900.