Le premier concile de Lyon, le treizième concile œcuménique, a eu lieu en 1245. Le deuxième concile de Lyon était le quatorzième concile œcuménique de l'Église catholique romaine, convoqué le 31 mars 1272 et convoqué à Lyon, Royaume d'Arles (dans la France moderne) , en 1274. Le pape Grégoire X présida le concile, appelé à donner suite à une promesse de l'empereur byzantin Michel VIII de réunir l'Église d'Orient avec l'Église d'Occident. Le concile réunit environ 300 évêques, 60 abbés et plus d'un millier de prélats ou leurs procureurs, parmi lesquels se trouvaient les représentants des universités. En raison du grand nombre de participants, ceux qui étaient venus à Lyon sans y avoir été spécifiquement convoqués ont reçu "l'autorisation de partir avec la bénédiction de Dieu" et du Pape. Parmi les autres personnes qui ont assisté au concile figuraient Jacques Ier d'Aragon , l'ambassadeur de l' empereur Michel VIII Palaiologos avec des membres du clergé grec et les ambassadeurs d' Abaqa Khan de l' Ilkhanat . Thomas d'Aquin avait été convoqué au concile, mais mourut en route à l'abbaye de Fossanova. Bonaventure était présent aux quatre premières sessions, mais mourut à Lyon le 15 juillet 1274. Comme au premier concile de Lyon, Thomas Cantilupe était un participant anglais et un aumônier papal. En plus d'Aragon, que James représentait en personne, des représentants de les rois d'Allemagne, d'Angleterre, d'Ecosse, de France, d'Espagne et de Sicile étaient présents, avec des procureurs représentant également les royaumes de Norvège, de Suède, de Hongrie, de Bohême, de Pologne et du "royaume de Dacie". Dans les procédures à observer dans le concile, les nations apparaissaient pour la première fois comme éléments représentés dans un concile ecclésiastique, comme elles l'étaient déjà dans le gouvernement des universités médiévales. Cette innovation marque un tremplin vers la reconnaissance des idées cohérentes de nation, qui étaient en train de créer les États-nations européens.

Les principaux sujets abordés au concile étaient la conquête de la Terre Sainte et l'union des Églises d'Orient et d'Occident. La première session eut lieu le 7 mai 1274 et fut suivie de cinq sessions supplémentaires les 18 mai 1274, 4 ou 7 juin 1274, 6 juillet 1274, 16 juillet 1274 et 17 juillet 1274. À la fin du concile, 31 constitutions étaient promulgué. Dans la deuxième session, les pères ont approuvé le décret Zelus fidei, qui ne contenait pas de statuts juridiques mais plutôt des constitutions résumées sur les périls de la Terre Sainte, les moyens de payer pour un projet de croisade, l'excommunication des pirates et des corsaires et ceux qui protégeaient eux ou commerçaient avec eux, une déclaration de paix entre chrétiens, l'octroi d'une indulgence pour ceux qui voulaient partir en croisade, le rétablissement de la communion avec les Grecs et la définition de l'ordre et de la procédure à observer dans le concile. Les Grecs ont concédé sur la question du Filioque (deux mots ajoutés au Credo de Nicée), et l'union a été proclamée, mais l'union a ensuite été répudiée par Andronicus II, héritier de Michel VIII. Le concile a également reconnu Rudolf Ier comme empereur du Saint Empire romain germanique, mettant fin à l'interrègne.