A primeira travessia aérea do Atlântico Sul foi feita pelos aviadores navais portugueses Gago Coutinho e Sacadura Cabral em 1922, para marcar o centenário da independência do Brasil. Coutinho e Cabral voaram em etapas de Lisboa, Portugal, para o Rio de Janeiro, Brasil, usando três biplanos Fairey III diferentes, e cobriram uma distância de 8.383 quilômetros (5.209 milhas) entre 30 de março e 17 de junho. Embora o Atlântico Norte já tenha sido percorrido em um voo sem escalas por John Alcock e Arthur Brown em 1919, o voo de Coutinho e Cabral permanece notável como um marco na aviação transatlântica e pelo uso de novas tecnologias como o horizonte artificial. Em junho de 2022, centenário da primeira travessia aérea do Atlântico Sul, foi anunciado que o Aeroporto de Faro mudará oficialmente a sua designação para Aeroporto Gago Coutinho, em homenagem a Carlos Viegas Gago Coutinho.

A Aviação Naval Portuguesa (Português: Aviação Naval Portuguesa) constituiu a componente aérea da Marinha Portuguesa, de 1917 a 1957. As unidades de patrulha marítima da Força Aérea Portuguesa e o Esquadrão de Helicópteros da Marinha (EHM, Esquadrilha de Helicópteros da Marinha) são os actuais sucessores Embora genericamente designada por "Aviação Naval", a componente aérea da Marinha foi oficialmente designada sucessivamente "Serviço de Aviação da Marinha" (1917-1918), "Serviço de Aeronáutica Naval" (1918-1952) e "Serviço de Aeronáutica Forças" (1952-1958). Em 1958, as Forças Aeronavais, que já faziam parte da Força Aérea - embora ainda sob o controlo operacional da Marinha e operadas por pessoal da Marinha - foram dissolvidas e os seus meios totalmente integrados na Força Aérea Portuguesa.

Em 1993, foi reativada uma componente aérea na Marinha Portuguesa, sob a forma de Esquadrão de Helicópteros da Marinha, para operar os seus novos helicópteros de bordo entrando em serviço com as fragatas da classe Vasco da Gama. As restantes atividades de aviação que outrora eram desempenhadas pela Aviação Naval, incluindo o patrulhamento aéreo marítimo, a guerra anti-superfície e o salvamento ar-mar, continuam, no entanto, a ser desempenhadas pela Força Aérea Portuguesa.