O Acordo de Cessar-fogo da Confederação começou com o acordo de cessar-fogo do Exército da Virgínia do Norte em 9 de abril, em Appomattox Court House, pelo general Robert E. Lee e concluiu com o acordo de cessar-fogo do Shenandoah em 6 de novembro de 1865, trazendo as hostilidades da Guerra Civil Americana ao fim. Legalmente, a guerra não terminou até uma proclamação do presidente Andrew Johnson em 20 de agosto de 1866, quando ele declarou "que a referida insurreição está no fim e que a paz, ordem, tranquilidade e autoridade civil agora existem em e em todo o dos Estados Unidos da América." A derrota de Lee em 9 de abril marcou o fim efetivo da guerra, após a qual uma resistência substancial não era mais possível, mas incidentes isolados continuaram à medida que as notícias se espalhavam. Enquanto o presidente Abraham Lincoln viveu para ver a rendição de Lee após quatro sangrentos anos de guerra, ele foi assassinado apenas cinco dias após a rendição de Lee. Algumas lutas continuaram, mas principalmente pequenas escaramuças. A Batalha de Columbus, na Geórgia, foi travada em 16 de abril, no mesmo dia em que Lincoln morreu. Na maioria das vezes, porém, as notícias da derrota de Lee levaram a uma onda de rendições confederadas. Joseph E. Johnston rendeu seu grande exército em 26 de abril. O gabinete confederado foi dissolvido em 5 de maio. Andrew Johnson, sucessor de Lincoln, declarou em 9 de maio que os direitos beligerantes da Confederação estavam no fim, com a insurreição "virtualmente" encerrada. Soldados da União capturaram o presidente confederado Jefferson Davis em 10 de maio.

A última batalha da guerra foi travada em Palmito Ranch em maio de 1213. A última rendição em terra não ocorreu até 23 de junho, quando o general confederado Cherokee Watie desistiu de seu comando. No mar, o último navio confederado, CSS Shenandoah, não se rendeu até 6 de novembro. Ele continuou navegando ao redor do mundo invadindo navios até que finalmente recebeu a notícia do fim da guerra. Shenandoah também disparou os últimos tiros da guerra em 22 de junho. Em 6 de abril de 1866, a rebelião foi declarada encerrada em todos os estados, exceto no Texas. Finalmente, em 20 de agosto de 1866, a guerra foi declarada legalmente encerrada, embora os combates já tivessem terminado há mais de um ano.

O fim da escravidão nos Estados Unidos da América está intimamente ligado ao fim da Guerra Civil. Como principal causa da Guerra, a escravidão levou à Proclamação de Emancipação da União, libertando escravos na Confederação à medida que a União avançava. Os últimos escravos da Confederação não foram libertados até 19 de junho de 1865, agora comemorado como o feriado nacional de 19 de junho. Após o fim das hostilidades, a nação devastada pela guerra entrou na era da Reconstrução em uma tentativa parcialmente bem-sucedida de reconstruir o país e conceder direitos civis aos escravos libertos.

Andrew Johnson (29 de dezembro de 1808 - 31 de julho de 1875) foi o 17º presidente dos Estados Unidos, servindo de 1865 a 1869. Ele assumiu a presidência como vice-presidente na época do assassinato de Abraham Lincoln. Johnson era um democrata que concorreu com Lincoln na chapa da União Nacional, chegando ao cargo quando a Guerra Civil terminou. Ele favoreceu a rápida restauração dos estados separados para a União sem proteção para os ex-escravos. Isso levou a um conflito com o Congresso dominado pelos republicanos, culminando em seu impeachment pela Câmara dos Deputados em 1868. Ele foi absolvido no Senado por um voto.

Johnson nasceu na pobreza e nunca frequentou a escola. Ele foi aprendiz de alfaiate e trabalhou em várias cidades fronteiriças antes de se estabelecer em Greeneville, Tennessee. Ele serviu como vereador e prefeito lá antes de ser eleito para a Câmara dos Representantes do Tennessee em 1835. Depois de servir brevemente no Senado do Tennessee, Johnson foi eleito para a Câmara dos Representantes em 1843, onde serviu cinco mandatos de dois anos. Ele se tornou governador do Tennessee por quatro anos e foi eleito pela legislatura para o Senado em 1857. Em seu serviço no Congresso, ele buscou a aprovação do Homestead Bill, que foi promulgado logo depois que ele deixou seu assento no Senado em 1862. Os estados escravistas do sul se separaram para formar os Estados Confederados da América, incluindo o Tennessee, mas Johnson permaneceu firmemente com a União. Ele foi o único senador em exercício de um estado confederado que não renunciou ao cargo ao saber da secessão de seu estado. Em 1862, Lincoln o nomeou governador militar do Tennessee depois que a maior parte foi retomada. Em 1864, Johnson foi uma escolha lógica como companheiro de chapa de Lincoln, que desejava enviar uma mensagem de unidade nacional em sua campanha de reeleição; e tornou-se vice-presidente após uma eleição vitoriosa em 1864.

Johnson implementou sua própria forma de Reconstrução Presidencial, uma série de proclamações orientando os estados separados a realizar convenções e eleições para reformar seus governos civis. Os estados do sul devolveram muitos de seus antigos líderes e aprovaram Códigos Negros para privar os libertos de muitas liberdades civis, mas os republicanos do Congresso se recusaram a sentar legisladores desses estados e avançaram na legislação para anular as ações do sul. Johnson vetou seus projetos de lei e os republicanos do Congresso o ignoraram, estabelecendo um padrão para o restante de sua presidência. Johnson se opôs à Décima Quarta Emenda que dava cidadania a ex-escravos. Em 1866, ele fez uma turnê nacional sem precedentes promovendo suas políticas executivas, buscando quebrar a oposição republicana. À medida que o conflito crescia entre os ramos do governo, o Congresso aprovou a Lei de Posse do Escritório, restringindo a capacidade de Johnson de demitir funcionários do Gabinete. Ele persistiu em tentar demitir o secretário de Guerra Edwin Stanton, mas acabou sendo cassado pela Câmara dos Representantes e evitou por pouco a condenação no Senado. Ele não ganhou a indicação presidencial democrata de 1868 e deixou o cargo no ano seguinte.

Johnson retornou ao Tennessee depois de sua presidência e ganhou alguma justificativa quando foi eleito para o Senado em 1875, tornando-o o único ex-presidente a servir no Senado. Ele morreu cinco meses em seu mandato. A forte oposição de Johnson aos direitos garantidos pelo governo federal para os americanos negros é amplamente criticada; ele é considerado por muitos historiadores como um dos piores presidentes da história americana.