Гондурас был заселен многими коренными народами, когда испанцы прибыли в 16 веке. Западно-центральную часть Гондураса населяли ленка, центральное северное побережье — тол, район к востоку и западу от Трухильо — печ (или пайя), майя и сумо. Эти автономные группы поддерживали коммерческие отношения друг с другом и с другими народами, такими отдаленными, как Панама и Мексика. В Гондурасе есть руины нескольких городов мезоамериканского доклассического периода, которые показывают доколумбовое прошлое страны.

Для прибытия испанцев были основаны новые города, такие как Трухильо, Комаягуа, Грасиас и Тегусигальпа. Начиная с колониальной эпохи территория современного Гондураса была посвящена сбору урожая, добыче полезных ископаемых и скотоводству. После обретения независимости от Испанской империи в 1821 году Центральная Америка на очень короткое время присоединится к первой Мексиканской империи, которая падет в 1823 году, и будет создана Центральноамериканская федерация, которая падет в 1839 году. После этого территория Гондураса стала независимым государством.