2011 年 5 月至 2011 年 6 月，一种新型大肠杆菌 O104:H4 菌株在德国北部引起了严重的食源性疾病暴发。这种疾病的特点是血性腹泻，严重并发症的发生率很高，包括溶血性尿毒症综合征 (HUS )，这种情况需要紧急治疗。爆发最初被认为是由大肠杆菌的肠出血性 (EHEC) 菌株引起的，但后来证明是由获得产生志贺毒素基因的肠聚集性大肠杆菌 (EAEC) 菌株引起的，存在于有机胡芦巴芽中。

流行病学实地调查表明，新鲜蔬菜是感染源。下萨克森州农业部长确定了位于德国下萨克森州 Bienenbüttel 的一个有机农场，该农场生产各种发芽食品，可能是大肠杆菌爆发的来源。农场被关闭了。尽管下萨克森州的实验室没有在农产品中检测到这种细菌，但北莱茵-威斯特法伦州的一个实验室后来在可疑农场丢弃的一包豆芽中发现了爆发菌株。一项控制调查证实该农场是疫情的源头。 2011 年 6 月 30 日，德国联邦食品、农业和消费者保护部下属机构德国联邦风险评估研究所 (BfR) 宣布，从埃及进口的有机胡芦巴种子可能是总共有 3,950 人受到影响，53 人死亡，其中 51 人在德国。 800 人患有溶血性尿毒症综合征 (HUS)，这可能导致肾功能衰竭。其他几个国家也报告了少数病例，包括瑞士、波兰、荷兰、瑞典、丹麦、英国、加拿大和美国。基本上所有受影响的人在生病前不久都在德国或法国。

最初，德国官员对大肠杆菌的可能来源和菌株做出了错误的陈述。德国卫生当局在没有持续检测结果的情况下，错误地将 O104 血清型与从西班牙进口的黄瓜联系起来。后来，他们认识到西班牙温室不是大肠杆菌的来源，黄瓜样本中不包含导致爆发的特定大肠杆菌变体。因此，西班牙对将其产品与致命的大肠杆菌爆发联系起来表示愤怒，这导致西班牙出口商每周损失 2 亿美元。从 6 月初到 2011 年 6 月 22 日，俄罗斯禁止从欧盟进口所有新鲜蔬菜。