当西班牙人在 16 世纪到达时，洪都拉斯居住着许多土著人民。洪都拉斯中西部居住着伦卡人，中北部海岸居住着托尔人，特鲁希略东部和西部地区居住着佩赫（或帕亚）、玛雅人和相扑人。这些自治团体相互之间以及与远至巴拿马和墨西哥的其他人口保持着商业关系。洪都拉斯有几个可以追溯到中美洲前古典时期的城市遗址，展示了该国前哥伦布时期的过去。

为了西班牙人的到来，建立了新的城市，如特鲁希略、科马亚瓜、格拉西亚斯和特古西加尔巴。从殖民时代开始，今天的洪都拉斯领土致力于收割、采矿和放牧。在 1821 年从西班牙帝国独立后，中美洲将在很短的时间内加入第一个墨西哥帝国，该帝国将在 1823 年垮台，中美洲联邦将在 1839 年成立。此后，洪都拉斯领土已经成为一个独立的国家。